К началу Великой Отечественной войны Казанский Государственный Институт для усовершенствования врачей насчитывал полных 20 лет своей истории
Уже с первых дней войны основное здание института по улице Комлева и II здание хирургической клиники (ул. Большая Красная) были заняты под эвакогоспитали. Один из них эвакогоспиталь № 0171 - начальник госпиталя Б.С. Гинзбург.
Институт направил на фронт и военные госпитали лучших своих сотрудников. Приказ ректора от 23 июня 1941 года 136 сотрудников ушли на фронт — один профессор, десять доцентов, сорок три ассистента, врачи, ординаторы, аспиранты, медицинские сестры, лаборанты санитары и обслуживающий персонал. Всего на фронт ушли более 300 сотрудников, а в военные госпитали были переведены более ста врачей, медицинских сестер и санитарок.
В. связи с требованиями военного времени были созданы новые учебные планы и программы. Первые два года войны занятия с врачами проводились непосредственно в госпиталях в вечернее время.
Профессора ГИДУВа занимали ответственные посты в военно — медицинских учреждениях, работали главными и ведущими специалистами фронтов, флотов и армий. Профессор Л.М.Рахлин — главный терапевт 19-й и 14-й армий Карельского фронта, профессор Н.Н. Спасский — главный эпидемиолог Северного фронта, профессор М.И. Мастбаум — главный терапевт Тихоокеанского флота. Должности главных хирургов объединений эвакогоспиталей занимали профессора В.А. Гусынин, Л.И. Шулутко, Ю.А. Ратнер; главного хирурга армии — доцент В.Н. Помосов. Заведующий кафедрой Ю.А. Ратнер состоял главным хирургом эвакогоспиталей ВЦСПС в Татарской и Удмуртской АССР.
В период Великой Отечественной войны основное место в планах занимали проблемы клинической диагностики и методов лечения огнестрельных ранений и их последствий, травм опорно-двигательного аппарата, черепа, грудной клетки и др. Суровым испытаниям подвергались все кафедры и клиники. Только за 1942 год в клинике профессора Е. М. Лепского пролечились 2273 ребенка, из них 64,6 процента - дети до трех лет. Под палаты были заняты учебные комнаты и кабинет директора клиники.
Деятельность Казанского ГИДУВа в годы Великой Отечественной войны — это коллективный подвиг всех его сотрудников - и тех, кто, не щадя себя, находился на переднем крае войны и тех, кто выполнял свой профессиональный врачебный долг, будучи в тылу.
Самый большой экспозиционный комплекс музея КГМА посвящён Великой Отечественной войне 1941—1945гг. Экспонируются письма с фронта, личные документы и фронтовые фотографии, грамоты, благодарственные письма Главнокомандующих. Фото и документы доцента П.А. Никифорова в первые дни войны — погиб, когда он находился прямо за операционным столом.
Украшением экспозиции являются наградные ордена и медали сотрудников академии - участников Великой Отечественной войны, А.Я. Логиновой, В.Н. Печниковой, А.З. Давлеткельдеевой, Ф.Ф. Кильматовой, Л.Н.Крепкогорского. Особую ценность представляет мемориальная коллекция военных лет профессора Л.М. Рахлина: стетоскоп, медицинский прибор Рива-Роччи, плащ-палатка и пилотка, клык моржа, привезенный им с Северного Ледовитого океана, когда он принимал участие в спасательной экспедиции челюскинцев (1934г.).
Интерес вызывает и фронтовой походный стерелизатор и хирургические инструменты хирурга В.С. Ефимова. Экспозицию военных лет завершает завещательное письмо врачам-курсантам, которое оставил первый ректор Клинического института (ГИДУВа) профессор Р.А. Лурия.
Заведующая Музеем Истории КГМА Г.М. Мингазова.